Doce años después, en 1536 Dios levantó a Juan Calvino, quien fue uno de los vasos más útiles para Dios en esa era. Calvino fue perseguido en todas partes: primero en Suiza y luego en Alemania. Dondequiera que iba encontraba oposición y exilio, hasta que finalmente, en Escocia, tuvo un nuevo comienzo y allí estableció la Iglesia Presbiteriana de Escocia.

En Inglaterra, a finales del siglo dieciséis y principios del diecisiete, se formó la Iglesia Anglicana; éste fue el inicio de la iglesia estatal en ese país. Pese a que la Iglesia Anglicana se liberó de la influencia de la Iglesia Católica Romana, aun así se ligó a la política británica, por lo cual se levantaron disidentes en Inglaterra. Estos disidentes se opusieron a la religión estatal ya que no compartían las mismas opiniones; ellos procuraban lograr la separación entre la iglesia y el estado, y afirmaban que la iglesia no debería estar bajo el control del estado. Aunque denunciaban osadamente los errores de la iglesia estatal, ellos mismos no se apegaron plenamente a las enseñanzas del Nuevo Testamento.